Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDR2Q01850 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms