Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms