Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAPAP54920 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPAP54920 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAPAP54920 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAPAP54920 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAPAP54920 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms