Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms