Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms