Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5F1P24539 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5F1P24539 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms