Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNB3P16520 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNB3P16520 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GNB3P16520 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms