Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms