Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ89

DUX4L6, Double homeobox protein 4-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L6P0CJ89 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4L6P0CJ89 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L6P0CJ89 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms