Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPBP07199 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPBP07199 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CENPBP07199 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPBP07199 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms