Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms