Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms