Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms