Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL359852.1-201ENST00000624609 2197 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SLC22A24-203ENST00000612278 2101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ASAP1-IT2-201ENST00000626977 2031 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZNF778-201ENST00000306502 2386 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CPNE4-210ENST00000512332 2230 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL049733.1-201ENST00000440178 603 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC089998.3-201ENST00000549715 493 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 KCNJ15-207ENST00000398934 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PFKM-203ENST00000359794 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GJA10-201ENST00000369352 1652 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MRNIP-204ENST00000518219 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms