Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 KRT18P59-202ENST00000534728 3338 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TRIM26-268ENST00000454678 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ANKRD50-201ENST00000504087 8794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DLGAP5-201ENST00000247191 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PPT1-209ENST00000530076 1872 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PMEPA1-203ENST00000347215 4546 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NXPE1-205ENST00000536312 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LRP1-207ENST00000554174 2175 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AP3M1-202ENST00000372745 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 IFT122-206ENST00000440957 4007 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TGM5-201ENST00000220420 2767 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CNTN4-203ENST00000418658 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 GFM2-201ENST00000296805 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NDUFAF5-202ENST00000378106 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CLDN19-203ENST00000539749 3517 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ARNT2-201ENST00000303329 6558 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FCRLA-209ENST00000367957 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 BTBD16-201ENST00000260723 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PGM3-205ENST00000506587 1971 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ACSBG1-201ENST00000258873 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FER1L5-205ENST00000623246 6513 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF615-214ENST00000618049 2284 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DLGAP1-AS5-202ENST00000565811 2594 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AF067845.2-201ENST00000617093 3049 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CNGA3-201ENST00000272602 3470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MET-201ENST00000318493 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ATP1A3-201ENST00000302102 3597 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZBTB3-201ENST00000394807 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00284-202ENST00000439707 2521 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000997.2-201ENST00000564619 8400 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 USP54-204ENST00000422491 2777 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00969-212ENST00000445430 4208 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AC138869.3-201ENST00000563960 2486 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 METTL2B-201ENST00000262432 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SNX20-203ENST00000423026 2156 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DUSP27-203ENST00000443333 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MED22-210ENST00000614493 3886 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZSCAN31-214ENST00000446474 2562 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms