Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms