Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLIRPQ9GZT3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms