Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms