Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms