Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms