Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms