Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC3LQ587J8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms