Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms