Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL12Q53G59 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms