Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms