Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN3Q16667 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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