Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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