Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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