Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS25P62851 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS25P62851 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms