Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFM1P61960 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFM1P61960 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFM1P61960 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UFM1P61960 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms