Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPA4P34932 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA4P34932 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms