Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms