Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
S100A1P23297 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
S100A1P23297 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
S100A1P23297 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
S100A1P23297 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
S100A1P23297 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms