Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM2P07951 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms