Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTMAP06454 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTMAP06454 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTMAP06454 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms