Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms