Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TXNDC9O14530 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms