Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms