Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms