Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms