Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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