Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 PMS2CL-204ENST00000486256 3327 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CLEC1A-201ENST00000315330 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 BAAT-202ENST00000395051 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DCX-210ENST00000637453 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL7-AS1-201ENST00000419813 2564 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC011195.2-201ENST00000583666 1486 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DBF4B-201ENST00000315005 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SYTL2-201ENST00000316356 4293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP20-1Q3LI63 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms