Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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