Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms