Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms