Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms