Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms