Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms