Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms