Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX7Q7RTT5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms